平和な川堂東市に『ギルツシード』がばら撒かれてしまう。
『ギルツシード』は人々の欲望を暴走させ、怪人化させる危険なモノである。
放っておけば間違いなく発生するであろう事件に対処すべく、
『井高野一花』は『相川春乃』にギルツシード回収を依頼する。
エクスデバイスを受け取った『相川春乃』は『エクスティア・イグニス』へと変身し、
ギルツシード回収に協力するのであった。
時を同じくして、夜の闇にもう一人のエクスティアの姿が浮かび上がる。
『相川春乃』と同じ学園に通う『菅原冬華』が『エクスティア・ルーナ』に変身した姿。
彼女もギルツシードを狙い、怪人と戦っている。
普段は口数少なくあまり目立たない存在である『菅原冬華』が、
『エクスティア・ルーナ』に変身して戦う理由とは一体……。